Special course on Nutritional ecology

More information on www.eko.uj.edu.pl/ecology
Please register participation in lectures by e-mail: pawel.koteja@uj.edu.pl

Statystyka, Harvard & iTunes

Czołem,

Uniwersytet Harvarda udostępnił ciekawy cykl wykładów o statystyce i rachunku prawdopodobieństwa, prowadzonych przez Joe Blitzsteina (zrobił Ph.D. pod okiem samego Persi Diaconis'a - w zasadzie to tak, jakby charyzmę i poczucie humoru miał wytatuowane na czole). Całość udostępniono (za darmo!) na platformie iTunes.

Krótki opis całego kursu:

Statistics 110 (Probability), taught at Harvard University by Joe Blitzstein (Professor of the Practice in Statistics) in Fall 2011. Lecture videos, homework, review material, practice exams, and a large collection of practice problems with detailed solutions are provided. This course is an introduction to probability as a language and set of tools for understanding statistics, science, risk, and randomness. The ideas and methods are useful in statistics, science, philosophy, engineering, economics, finance, and everyday life. Topics include the following. Basics: sample spaces and events, conditional probability, Bayes’ Theorem. Random variables and their distributions: cumulative distribution functions, moment generating functions, expectation, variance, covariance, correlation, conditional expectation. Univariate distributions: Normal, t, Binomial, Negative Binomial, Poisson, Beta, Gamma. Multivariate distributions: joint, conditional, and marginal distributions, independence, transformations, Multinomial, Multivariate Normal. Limit theorems: law of large numbers, central limit theorem. Markov chains: transition probabilities, stationary distributions, reversibility, convergence.

Link do kursu




Pozdrawiam,
Kuba Szymkowiak

Stypendia START przyznane!

Na stronie internetowej Fundacji na rzecz Nauki Polskiej jest już lista laureatów ostatniej edycji konkursu START:

http://www.fnp.org.pl/aktualnosci/aktualnosci/rok_2012/start_2012_laureaci_konkursu

stypendium otrzymała m.in. Magda Lenda - gratulacje!
michał żmihorski

SYMBIOZA na Warsztatach Biologii Ewolucyjnej

Polska Akademia Nauk, Komitet Biologii Ewolucyjnej i Teoretycznej
Instytut Nauk o Środowisku Uniwersytetu Jagiellońskiego

LVI Warsztaty Biologii Ewolucyjnej

Warszawa, sobota 24 marca 2012

10:30 Otwarcie

10:40 Katarzyna Turnau (Uniwersytet Jagielloński) „Kiedy 1+1+1=1, czyli o wszechobecności symbiozy”

11:30-11:40 krótka przerwa

11:40 Krzysztof Wiąckowski (Uniwersytet Jagielloński) „Symbioza, chloroplasty i miksotrofia u Protista”

12.30 -14.00 przerwa na posiłek

14:00 Grzegorz Wojtczak (Uniwersytet Jagielloński) „Znaczenie symbiozy w ewolucji Storczykow”.

14:20 Marta Wrzosek (Uniwersytet Warszawski) "Grzyby jako partnerzy mutualistyczni owadów"

14:40 Maciej Bartos (Uniwersytet Łódzki) „W jaki sposób niedoświadczone pająki identyfikują swoje ofiary?”

Organizatorzy dziękują Wydziałowi Biologii Uniwersytetu Warszawskiego za gościnę i wszechstronną pomoc.

Informacje organizacyjne na www.eko.uj.edu.pl/wbe

Nowe konkursy NCN

Ogłoszenie o czterech nowych konkursach pojawiło się na stronach NCNu. Z nowości - pojawiła się SONATA BIS, w ramach której mogą startować osoby do 10 lat po doktoracie (w SONACIE jest limit 5 lat).

Więcej w ogłoszeniu:
http://www.ncn.gov.pl/aktualnosci/2012-03-15-ogloszenie-konkursow-opssb

ciekawe są też rozwiązania dodatkowe, ewidentnie nastawione na ograniczenie składania wniosków niskiej jakości i przez osoby słabo zmotywowane, m.in.:

1. ocena merytorycznej części wniosku w I etapie ... dokonywana jest na podstawie tylko skróconego opisu projektu
2. 20% kierowników najsłabszych projektów nie będzie mogło wystąpić z wnioskiem o finansowanie w kolejnej edycji konkursów
3. wnioskodawca ma obowiązek złożenia wraz z wnioskiem o finansowanie projektu badawczego... [wszystkich niezbędnych zgód i pozwoleń]

O ile do punktów 1 i 2 nie mam zastrzeżeń, o tyle wydaje się, że punkt 3 generuje w skali kraju rzekę niepotrzebnych pism (niepotrzebnych bo ok 70-80% grantów odpada) i setki tysięcy osobogodzin pracy potrzebnej na pisanie i odpisywanie na te pozwolenia...

"Kto się cieszy, a kto martwi?" - o NCNie pisze jego dyrektor

Warto rzucić okiem na artykuł prof. Jajszczyka

link

michał żmihorski

Czas na ocenę efektów...

W tekście prof. Kudryckiej pojawia się w ostatnim akapicie ciekawy wątek - ocena efektywności środków wydanych na badania:

"Pracujemy obecnie nad koncepcją systemu oceny wydatkowania środków na badania w kontekście osiąganych wyników naukowych i wdrożeniowych."

Z mojej strony następujące uwagi do tej kwestii, bo może warto zgłaszać takie pomysły wcześniej:

1. Przy normalnie prowadzonym grancie nie ma raczej szans na wykazanie efektów w momencie zakończenia grantu - zawsze są poślizgi czasowe, pisanie prac zabiera dużo czasu, proces redakcyjny to kolejne kilka - kilkanaście miesięcy. Nie wspominam już o grantach typu Iuventus, które trwają np. rok... Więc warto, żeby to ktoś jasno powiedział, że na dzień zamknięcia grantu nie będzie jeszcze publikacji - moim zdaniem tego czasu potrzeba więcej, kwestia ustalenia ile.

2. Jakie publikacje wchodzą do efektów danego grantu? - temat zupełnie niejasny... Czy jeżeli kupię z grantu ornitologicznego laptopa i na nim napiszę pracę o mrówkach, to czy mogę napisać, że jest ona częściowo finansowana z grantu? No bo przecież jest! A jeżeli wykonując obserwacje ptaków zobaczę rzadkiego chrząszcza i to opublikuję? Przecież dojazd w teren był finansowany przez MNISW/NCN, inaczej bym tego chrząszcza nie zobaczył... Jeżeli zostały mi po zakończeniu grantu odczynniki i zrobię na nich dodatkowe analizy to mogę wyniki tych analiz podpinać pod efekty grantu? Tego typu pytań i sytuacji można przytoczyć nieskończenie wiele i jedynym rozsądnym rozwiązaniem jest totalnie liberalne i całościowe podejście do problemu. Wszystkie publikacje powstałe w trakcie lub np. 2-3 lata po zakończeniu grantu wrzucałbym jako dorobek tego grantu. Każde rozdzielanie tematyczne i czasowe jest skazane z góry na niepowodzenie...

michał żmihorski

Kultura grantowa według pani minister

Prof. Barbara Kudrycka, minister nauki i szkolnictwa wyższego: Jak oceniać obiektywnie

Tekst w Gazecie Wyborczej

Wyniki konkursu NCN dla doświadczonych

Wczoraj pojawiły się na stronie NCNu wyniki konkursów dla doświadczonych naukowców.

Tutaj komunikat:
http://www.ncn.gov.pl/aktualnosci/2012-02-17-wyniki-doswiadczeni

a tutaj lista w kategorii "nauki o życiu"
http://www.ncn.gov.pl/finansowanie-nauki/konkursy/wyniki/maestro15-06-2011-nz

na pierwszy rzut oka dominacja "neuro-cyto-genetyki", chyba tylko jeden projekt ekologiczny. Wynik ten może sugerować, że polska działka eko-ewo jest jednak relatywnie słaba...

michał żmihorski

Likwidacja CBE PAN

od jakiegoś czasu wiadomo, że Centrum Badań Ekologicznych PAN w Dziekanowie Leśnym zostanie zlikwidowane. Różne są przypuszczenia dotyczące sposobu samej likwidacji i sytuacji prawnej nieruchomości należącej do CBEPAN. Jednym z pomysłów jest podobno przejęcie majątku CBEPAN przez Uniwersytet Kardynała Stefana Wyszyńskiego (UKSW) w Warszawie. Tak czy inaczej, wydaje się, że upadek CBEPAN jest już kwestią kilku najbliższych miesięcy. Tutaj decyzja Prezesa PAN w tej sprawie:

http://www.kancelaria.pan.pl/images/stories/pliki/akty_prawne_dokumenty/decyzje/decyzje%202012/Decyzja%20Nr%207%20z%20dn.23.01.12.pdf

michał żmihorski

MaxEnt: tango down?

Polecam świeży (on-line early) artykuł Andy Royle’a i in. opublikowany w Methods in Ecol & Evolution. Royle i jego bezwstydni koledzy (wśród nich następny gigant: Jim Nichols) zaatakowali MaxEnt, czyli powszechnie używany software (dokładniej: jego algorytm) do predyktywnego mapowania rozmieszczenia stworzeń w oparciu o dane typu „presence-only”. MaxEnt był w ostatnich latach bardzo popularny jako najbardziej przyjazne użytkownikowi narzędzie modelowania takich danych i uzyskiwania nadspodziewanie dobrych map rozmieszczenia potencjalnego. Ponieważ nie skalałem się użyciem MaxEnta (podobnie jak i jakiegokolwiek innego algorytmu species distribution models), więc nie będę rozwijał tematu, czekając na odzew innych PT Uczonych Kolegów. Jak dla mnie, zapowiada się ciekawy okres na froncie SDM. Wygląda na starcie gigantów, bo po stronie MaxEnta zaangażował się ostatnio Trevor Hastie (artykuł maxent dla blondynek w Div & Distr 2011), więc – biorąc pod uwagę równie dobre nazwiska gości od artykułu w MEE – powinno być ciekawie.

 

Przemek Chylarecki

Kata­log blo­gów naukowych

Na zaprzyjaźnionym blogu "Warsztat badacza komunikacji" Emanuel Kulczycki zamieścił (a w zasadzie zamieszcza, bo projekt jest w trakcie realizacji) katalog blogów naukowych (my też jesteśmy!). Warto rzucić okiem, jest sporo ciekawych i wartych odwiedzenia, jest też troszkę info o samych blogerach.

więcej tu:

http://ekulczycki.pl/warsztat_badacza/katalog-blogow-naukowych/

Nawiasem mówiąc ciekawy blog i zachęcam do odwiedzania!
michał żmihorski

wizualizacja vol. 2

kontynuując temat wizualizacji danych, podsyłam dwa kolejne linki:

1. Świetne animacje występowania różnych gatunków ptaków na terenie USA, wszystko na bazie STEM-ów.

klik!

2. Coś, co właściwie trudno nazwać, bo zdecydowanie wykracza rozmachem poza granice tego, co zazwyczaj rozumiemy pod hasłem 'wizualizacja danych'.

Cytując za flowingdata.com:

"It begins with the capture of a grizzly, its tagging, and then release, as a first-person narrative tells a story through the eyes of the bear. You, the observer, are allowed to follow the bear and explore its environment on an abstract map, and somewhere along the way digital and the physical world melt together."

Czyli projekt Bear71:

klik!


Pozdrawiam,
Kuba Szymkowiak

Jak napisać maszynopis

W chwilowym odpływie inwencji przy pisaniu maszynopisu pogrzebałem po blogach i znalazłem taki oto zbiór porad.
Polecam, bo napisane z humorem, a niektóre porady są naprawdę ciekawe:
"Do not quote dead people too often; they won't be your referees", albo:
"Do not read too much before you begin to write" ;-))
Miłego czytania,
Pozdrawiam
Piotrek

Klasyka gatunku, machine learning i magiczne 0.05

Od początku, czyli:

Klasyka gatunku w postaci prac samego Sir Ronalda Fishera. Są to bodajże wszystkie prace jakie kiedykolwiek wyszły spod jego pióra, do tego całość zebrana i zdigiatalizowana w jednym miejscu:

klik!

Kurs machine learning - u najlepszych, a w dodatku za darmo!

klik!

Magiczne 0.05 - czyli time to blow up the cathedral ;)

klik! (notka)
klik! (pdf)


Pozdrawiam,
Kuba Szymkowiak