sobota, 18 maja 2019

Poradnik demaskatora - książka w PDF


Zostałem poproszony o zamieszczenie tu namiarów na książkę "Praktyczny Poradnik Demaskatora" której autorem jest Brian Martin. Całość (po polsku) do pobrania tu: https://www.bmartin.cc/pubs/19wb-Polish.pdf Książka jest też do kupienia w wersji papierowej: http://www.lulu.com/shop/brian-martin/whistleblowing-polish/paperback/product-23951641.html

Sam autor jest emerytowanym profesorem i niezłym naukowcem, tu jego dorobek:

Książki nie miałem okazji (jeszcze) przeczytać, ale z szybkiej oceny tematyki, jakiej dotyczy, i pobieżnego przejrzenia kilku rozdziałów, wydaje się, że może być przydatna w naszym środowisku. Plagiaty, ustawione konkursy, przekręty przy przyznawaniu i rozliczaniu grantów, nadużycia pozycji i władzy, i wiele innych form nieuczciwości w środowisku akademickim niestety zdarzają się i to całkiem często. Dla polepszenia jakości nauki w Polsce konieczne jest zgłaszanie i walczenie z tymi nieuczciwościami, ale na ogół nie wiemy jak sobie z nimi radzić, kiedy i jak działać, by być skutecznym ale i bezpiecznym, kiedy działań zaniechać, itp. - to wszystko ważne pytania, na które brakuje dobrych przepisów. Być może ten tekst okaże się pomocny, bo wydaje się mieć dwie użyteczne cechy: jest oparty na praktyce i doświadczeniu autora oraz przywoływanych w tekście konkretnych osób i spraw. Po drugie, autor wali prosto z mostu: co i jak robić, a czego unikać. 

Tu fragment, dla zachęty - opis jednej z metod działania, jaką jest przeciek:
Michał Żmihorski



wtorek, 14 maja 2019

Zmiana ustawy o PAN

Krąży w sieci projekt ustawy o zmianie ustawy o PAN. Nie czytałem, ale znajomi informują, że nie wszystkie proponowane zmiany dają powód do optymizmu. Ktoś czytał, mamy jakieś uwagi czy wnioski z tego tekstu?
Gdyby ktoś się już zapoznał z projektem prosimy o podzielenie się wrażeniami.

A tu fragment wywiadu (całość dostępna dla prenumeratorów) jakiego prezes Duszyński udzielił Gazecie Prawnej:
https://serwisy.gazetaprawna.pl/praca-i-kariera/artykuly/1409440,prof-jerzy-duszynski-nowelizacja-ustawy-o-pan.html

Michał Żmihorski

środa, 8 maja 2019

PhD position, Institute of Oceanology Polish Academy of Sciences


INSTITUTION: Institute of Oceanology Polish Academy of Sciences, Sopot, Poland

POSITION: scholarship position, PhD student type

REQUIREMENTS:
·        Master's level of studies in discipline related to the project’s scope (e.g., bioinformatics)
·        Experience and interest in ecology/biology (and/or earth sciences)
·     Good skills in statistics including multidimensional analyses (e.g., PCA, ANOSIM, RDA, t-sne, ANOVA, Hierarchical Clustering, etc.)
·    Experience in programming languages (e.g., R, Matlab, Python etc.) and in modeling (preferably shortly illustrated in portfolio)
·       Very good level of written and oral English language
·       Experience in publishing scientific results
·      Good communication skills, high motivation for work in interdisciplinary team/scope, passion for science, creativity

In addition to the above formal requirements, the candidate is expected to represent:
- education in the broad range of biological and ecological sciences and sincere interest in the use of numerical methods for a better understanding of the processes that shape marine ecosystems;
- high degree of motivation, communicativeness, creativity, reliability, diligence, punctuality, the ability to work both independently and in a team, and the ability to critically evaluate the obtained results;
- involvement in the field work in difficult conditions (e.g., seasickness, limited space on the research ship) and non-standard working hours (e.g., night shifts during cruises, travelling to and/or participating conferences during the weekend) and no health contraindications to work at sea;
- active participation in conferences, festivals and other forms of dissemination of project’s results and preparation of scientific publications in English at a high, international level.

Moreover, after the acceptance of the candidate she/he must meet the conditions of the regulations for granting research scholarships in research projects financed by the NCN funds, in particular:

PROJECT/JOB DESCRIPTION:
Project title: Changes in the structure and functioning of pelagic ecosystems affected by water darkening due to glacier/river runoff in the fjords of European Arctic (CoastDark)

Project description: The objective of the project is to analyse the influence of water darkening, due to the intensified glacier/river runoff, on the functioning of the marine pelagic food webs in the Arctic coastal waters. The aim is to quantify how the share of living plankton organisms in relation to mineral and organic particles will change along the gradient from the glacier/river discharge towards the open waters in the fjords of the western Spitsbergen. The project sampling will be carried out during two summer campaigns (July, 2019 & 2020) from the R/V “Oceania” in different fjords of the west Spitsbergen (e.g., Hornsund, Adventfjord, Kongsfjord). The investigation will be performed by the application of both modern optical methods and traditional oceanographic approaches. The water content at particular stations and depth water layers will be attributed to several traits: size, type (mineral vs organic, living vs dead) and composition. The final project result will be a model that will simulate the composition of various seawater components under different environmental scenarios.

Job description: Active participation in lab work, data collection (cruises) and preliminary analysis. Leading role in the design of a numerical model dealing with the content of “glacial soup” (plankton vs. suspended matter) in the Arctic coastal waters concerning various environmental  scenarios. Implementation, testing and validation of the model and numerical calculations. Active participation in summary, presentation and publication of project results.

FOUNDING SOURCE: NCN, OPUS-NZ
EMPLOYMENT CONDITIONS:
Scholarship in the amount of PLN 4 500 PLN per month, paid for 36 months. The scholarship can start between July and October 2019.
During being a beneficiary of the NCN scholarship at the maximum level, which is planned within this project, the candidate cannot receive any other remuneration from the NCN's funds (under a contract of employment and/or civil law contracts).
Applications should be submitted by 14th June 2019, 4:00 p.m., via e-mail to the following addresses: kasiab@iopan.pl (project’s co-ordinator) and/or dob@iopan.pl with a title: "PhD student – CoastDark".
We will contact selected candidates by email by 17th July 2019.

REQUIRED DOCUMENTS:
1) Cover letter
2) Curriculum vitae with a list of achievements (including the list of publications and description of skills useful in the project, in which the candidate has experience)
3) Master's degree diploma (a copy will be needed in August/September 2019 in order to meet NCN requirements for PhD studies)
4) Short and concise 'portoflio' illustrating the previous research experience (part of conference/seminar/poster presentation)
5) At least one recommendation letter and/or opinion on the candidate from the previous supervisor (of MSc thesis) or former directors with whom the applicant has previously cooperated with the contact details
6) Information clause on the processing of personal data (http://www.iopan.gda.pl/praca/INFORMATION_ON_THE_PROCESSING_OF_PERSONAL_DATA.pdf) together with the signed consent (signed scan) - http://www.iopan.gda.pl/praca/CONSENT_CLAUSE.pdf

All required documents should be saved in one PDF file.

The detailed conditions of employment are defined in the "Regulations for granting scholarships in research projects financed from the resources of the National Science Centre determined by the decision of the NCN Council no. 96/2016 of October 27, 2016."

The competition will be settled by 15th July 2019. The candidate who receives the highest number of points on the ranking list will be employed. Employment may be offered to the next person on the ranking list in a situation when the laureate of the competition resigns from signing the scholarship agreement.

poniedziałek, 22 kwietnia 2019

Postdoc, Lab Manager and Ph.D. Student positions - Insect Microbiomes


The forming Symbiosis Evolution research group at the Institute of Environmental Sciences at Jagiellonian University (www.symbioses.pl) has several open positions. The appointed researchers will implement and apply high-throughput next-generation sequencing and bioinformatics to the study of the ecological and evolutionary dynamics of the microbial symbioses of insects. The research is funded by NAWA Polish Returns grant "Insect Microbiomics" and NCN Sonata Bis grant "The evolutionary dynamics of the symbioses of Auchenorrhyncha".

POSTDOCTORAL RESEARCHER - INSECT MICROBIOMES
A NAWA-funded Postdoctoral Researcher position focused on the diversity and dynamics of insect microbiomes is available from 1 July 2019 for 48 months. The Postdoc will initially focus on the development of molecular methods and bioinformatic protocols for a high-throughput survey of insect microbiomes. Later, they will lead the characterization of microbiomes in extensive collections of insects and work on the analysis of the resulting data.
*** Details at https://symbioses.pl/wp-content/uploads/2019/04/Postdoc_UJ_Insect_Microbiomes.pdf
*** The review of applications starts in early May.

LAB MANAGER / RESEARCH TECHNICIAN
A NAWA-funded Laboratory Manager position is available from 1st July 2019 for 48 months. The appointed person will provide logistics and administrative support to the growing team, ensure the efficient function of the laboratory, and participate in research (sample management and processing).
*** Details (in Polish) at https://symbioses.pl/wp-content/uploads/2019/
04/LabTech_UJ_Insect_Microbiomes.pdf
*** The review of applications starts on 24th April.

PH.D. STUDENT - EVOLUTION OF INSECT SYMBIOSES
An NCN-funded Ph.D. Student position starts on 1st October 2019. The Student will focus on the bioinformatic reconstruction of co-diversification and replacement of heritable nutritional endosymbiotic bacteria and fungi across the diversity of the hemipteran suborder Auchenorrhyncha, and phylogenomic analyses of the host and symbiont relationships.
*** Details at https://symbioses.pl/wp-content/uploads/2019/04/PhD_UJ_Insect_Symbioses.pdf
*** The review of applications starts on 12th May 2019.

POSTDOCTORAL RESEARCHER IN BIOINFORMATICS - SWEDEN
Also, we are looking for a Postdoc (24 months), who will be based at the Swedish Museum of Natural History in Stockholm, Sweden, but work closely with our group at Jagiellonian University. As a part of an international team conducting one of the most extensive insect biodiversity surveys to date, the Postdoc will develop bioinformatic pipelines for the high-throughput analysis of insect community metabarcoding data and apply them to a massive collection of bulk insect samples from across Sweden and Madagascar.
*** Details at https://symbioses.pl/wp-content/uploads/2019/04/Postdoc_NRM-IBA_Bioinformatics.pdf
*** Application deadline - 12th May.

Questions? Please e-mail Dr. Piotr Łukasik - p.lukasik@gmail.com

poniedziałek, 25 lutego 2019

Konferencja studencka "ECHO - Ecology in a Changing World" i reaktywacja Polskiego Towarzystwa Ekologicznego

W dniach 23-25 marca 2019 w Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego odbędzie się studencka konferencja "ECHO - Ecology in a Changing World". Konferencja zakończy się spotkaniem na temat wznowienia działalności Polskiego Towarzystwa Ekologicznego. Poniżej list inicjatorów spotkania.
Szczegóły dotyczące spotkania i konferencji oraz rejestracja na stronie http://www.biol.uw.edu.pl/echo
 
 

środa, 20 lutego 2019

NCN i NCBiR mają braciszka: Fundusz Polskiej Nauki!


Sukcesy z grafenem zachęciły do dalszych działań w dziedzinie komercjalizacji:

"Projekt przewiduje, że Fundusz ma powstać w Banku Gospodarstwa Krajowego (BGK) i zostanie dofinansowany kwotą 500 mln zł. Z Funduszu finansowana ma być nowatorska formuła współpracy naukowej: wirtualny instytut badawczy (WIB). WIB będzie stanowił formę organizacji pracy wyselekcjonowanych, konkurencyjnych na poziomie międzynarodowym zespołów badawczych, prowadzących działalność naukową o wysokim potencjale zastosowań społeczno-gospodarczych, której wyniki mają zostać skomercjalizowane. Pracami pokieruje lider o uznanym dorobku naukowym

Całość:

Michał Żmihorski

wtorek, 19 lutego 2019

czwartek, 14 lutego 2019

Nurzyki vs współczesna biologia środowiskowa

W ostatnich dniach pojawiła się przykra informacja o śmierci ogromnej liczby 20 000 nurzyków Uria aalgae, której okoliczności są obecnie ustalane: https://www.birdguides.com/news/estimated-20-000-guillemots-dead-in-mysterious-circumstances/?utm_source=newsletter&fbclid=IwAR0gAxsdfjBaH1eEytXUQHqJih8SquKCnzjTpFSmmjlqfhtZkYUwyN7hKak
W związku z tym kilka pytań:
  1. Czy biologów interesują jeszcze przykre zdarzenia takie jak pod powyższym linkiem i czy nauka, jaką uprawiamy wystarcza, żeby je wyjaśniać, merytorycznie reagować i przeciwdziałać? Jeżeli nie, to po co jesteśmy biologami i czy nauka dla samego poznania bez praktyki ma sens?
  2. Czy współczesny pracownik naukowy ma możliwości, motywację i narzędzia, żeby wstać od biurka i zbadać temat? Czy na tę decyzję wpływa istotność sprawy, czy raczej możliwość opublikowania wyników? Przecież biologia środowiskowa nie daje się publikować tak wysoko jak genetyka, biologia molekularna, czy medyczna…
  3. Jakie mamy w Europie narzędzia współpracy międzynarodowej, żeby przewidywać podobne tragedie i wspólnie im przeciwdziałać? Jak utrzymywanie współpracy między różnymi instytucjami ważne w badaniu globalnych problemów ma się do zapowiadanych zmian w podziale punktów między autorami publikacji wielo-autorskich?
  4. Czy współcześni biolodzy – nierzadko zajęci badaniami na gatunkach modelowych (sikory, gupiki, zeberki, itp.) – są jeszcze zainteresowani tym co się dzieje w naturalnym środowisku ze zwierzętami i dostrzegają podobne problemy?

Emilia Grzędzicka