poniedziałek, 31 października 2011

forthcoming...

Biecek w swojej ostatniej książce cytuje coś takiego:
Burzykowski i Galicki (2011) Linear and Mixed Effects Models Using R. Springer (in press)
wygląda na to, że będzie w sam raz pod choinkę :o) Ale w sieci nie mogę nic znaleźć na razie...

a w kwietniu ma wyjść coś takiego: Chao i Lost "Diversity analysis". Nazwiska mocne więc na pewno warto się temu przyjrzeć
http://www.amazon.co.uk/Diversity-Analysis-Anne-Chao/dp/1420065246/ref=sr_1_1?s=books&ie=UTF8&qid=1320096834&sr=1-1

michał żmihorski

glmmy

Ukazała się ciekawa pracka: "on fitting glmm for binary responses..."
- http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/sim.4265/pdf

Co jeszcze ciekawsze - szybko stala sie dosc kontrowersyjna. Ben
Bolker (świetny statystyk i modelarz) reanalizował publikowane tam
wyniki (okazuje się że dataset dostępny jest w R) i kolokwialnie mówią
wyszło mu co innego:
http://glmm.wdfiles.com/local--files/examples/Zhang_reanalysis.pdf Na
liście r-sig-mixed (jedna z list dyskusyjnych R) toczy sie dyskusja co
i jak i dlaczego wychodzi inaczej. Pouczajace, postaram się postować w
komentarzach co ciekawsze konkluzje (całość na razie się zdaje
rozkręcać ;)).

pozdrawiam
sz.

poniedziałek, 24 października 2011

"Null-hypothesis tests are not completely stupid,

..but Bayesian statistics are better.' (Rindskopf, 1998)

Do poczytania, na coraz to dłuższe jesienne wieczory:



http://www.stats.org.uk/ (polecam szczególnie - potężny zbiór literatury statystycznej, zwłaszcza w "What is wrong with classical statistics?").

A wszystko oczywiście kręci się wokół:







Pozdrawiam,
Jakub Szymkowiak

piątek, 21 października 2011

neuroekologia

Ostatnio modne jest dodawanie roznych dziwnych przedrostkow do slowa
"ekologia". tutaj - nawet ciekawy ;) - przyklad: rzecz o
neuroekologii:

http://icb.oxfordjournals.org/content/51/5/751.abstract?etoc

pozdrawiam
\szymek

czwartek, 20 października 2011

Workshop on Evolutionary Medicine

Polish Academy of Sciences

Committee of Evolutionary and Theoretical Biology,

Faculty of Biology, University of Warsaw,

Institute of Environmental Sciences, Jagiellonian University


LV Workshop: Evolutionary Biology and Related Topics


Evolutionary Medicine


Warsaw, Saturday, 22nd October 2011



Workshop organiser: Grażyna Jasieńska


Programme:

10.30 Opening

10.40 Randolph M. Nesse (University of Michigan, USA) "Medicine without evolution is like engineering without physics"


11.40-12.00 coffee break


12.00 Grażyna Jasieńska (Institute of Public Health, Jagiellonian University, Krakow) "Evolutionary public health: Why is it difficult to improve health without knowing evolutionary biology?"

12.25 Adam Łomnicki (Mammal Research Institute of the Polish Academy of Sciences, Bialowieza) "For how long is the life without natural selection possible? "


12.50 - 14.20 lunch break


14.20 Maria Kapiszewska (Andrzej Frycz Modrzewski Krakow University) "Diet-related selective pressure on genes involved in metabolism"

14.45 Ilona Nenko (Institute of Public Health, Jagiellonian University, Krakow) "Reproductive history, energy budget and maternal lifespan"


15.10 – 15.30 coffee break


15.30 Filip Rybakowski (Institute of Psychiatry and Neurology, Warsaw) "Evolutionary aspects of addiction"

15.55 Maciej Zatoński (Department of Otolaryngology, FoD, Medical University of Wroclaw) "Evolution and medicine in Poland - time to introduce evolutionary mechanisms to doctors and their patients"


16.20 - 17.00 general discussion led by Randolph Nesse


Informacje organizacyjne na www.eko.uj.edu.pl/wbe

wtorek, 18 października 2011

Kwestionuj autorytety. Prawda jest w danych

Naprawdę ciekawe podejście do otaczającego nas świata i weryfikacja informacji, którymi karmią nas np. media - rzetelna analiza danych w wykonaniu Przemysława Biecka! Mimo, że tematy mało przyrodnicze warto rzucić okiem, bo autor pokazuje jak można analizować i wizualizować dane. No i oczywiście z wykorzystaniem programu RRRRR :o))
Polecam:

SmarterPoland

 

michał żmihorski

piątek, 14 października 2011

Analiza danych z programem R

P.Biecek

Analiza danych z programem R

Modele liniowe z efektami stałymi, losowymi i mieszanymi



ukaże się "w pierwszej połowie października 2011", więc zaraz! Mam nadzieję, że to będzie coś fajnego. Więcej o książce TU
michał żmihorski

poniedziałek, 10 października 2011

Diagnoza mobilności instytucjonalnej i geograficznej osób ze stopniem doktora w Polsce w roku 2009

Jakiś czas temu przypadkowo trafiłem na dość interesujący raport dotyczący mobilności doktorów w Polsce.
Szukałem na blogu i szukałem - ale nie zauważyłem, żeby pojawiło się to wcześniej. Jeśli info o tym raporcie już było - dajcie znać, post będzie do skasowania ;)


Na początek krótka notatka:

"Najistotniejszym wnioskiem z analiz przeprowadzonych na potrzeby raportu Diagnoza mobilności instytucjonalnej i geograficznej osób ze stopniem doktora, opracowanego przez Dominika Batorskiego, Michała Bojanowskiego i Dominikę Czerniawską we współpracy z Maciejem Ostaszewskim i Jackiem Szejdą (ICM oraz OPI, 2009) jest bardzo niski poziom mobilności międzyinstytucjonalnej rozumianej jako zmiana miejsca pracy. Skala zatrudniania pracowników naukowych w miejscu, w którym uzyskali stopień doktora, jest bardzo wysoki – zdecydowanie wyższy niż w innych krajach europejskich. Natomiast zmiana instytucji po uzyskaniu stopnia doktora jest prawie zawsze związana z przenosinami do biznesu lub administracji, a także z przejściem do mniejszych uczelni, nie-posiadających uprawnień do nadawania stopni i koncentrujących się na dydaktyce. Szczególnie wysoki poziom wsobności zatrudnienia jest w uczelniach największych i najważniejszych, aż 85-95% ich pracowników to osoby, które otrzymały doktorat na tej samej uczelni.

Zmiana miejsca zatrudnienia po uzyskaniu doktoratu wiąże się ze statystycznie większą liczbą publikacji książkowych, a przede wszystkim z około dwukrotnie większą liczbą zgłaszanych wniosków patentowych, stwierdza raport. Brak mobilności instytucjonalnej nie sprzyja rozwojowi kontaktów naukowych, które są podstawą w rozwoju zawodowym, mobilności terytorialnej i współpracy pomiędzy zespołami badawczymi."

(źródło: http://tnij.org/mnisw-raport)

I link do pdf'a:
http://tnij.org/raportdoktorzy



Pozdr,
Jakub Szymkowiak

wtorek, 4 października 2011

Stypendia dla młodych naukowców przyznane

MNiSW ogłosiło listę osób, którym przyznano stypendia za wybitne osiągnięcia w nauce w ramach programu dla młodych naukowców (do 35 lat). Po szybkim przejrzeniu widzę, że jest wśród laureatów co najmniej dwóch ekologów: Piotrek Skórka i Rafał Zwolak - gratulacje!

lista stypendystów TU

michał żmihorski

sobota, 1 października 2011

Mendeley

Być może wszyscy już Mendeley'a znają, a ja "odświeżam kotleta", ale może są też tacy jak ja, którzy poznali dopiero niedawno.

Krótko z czym mamy do czynienia:

i właściwy link:

http://www.mendeley.com/

Mnie osobiście zainteresowała możliwość posłania bazy pdf'ów w chmurę i regularna jej synchronizacja - dostęp do wszystkich (lub tylko wybranych przez nas) prac, z dowolnego miejsca na Ziemi, bez konieczności podpinania pod komputer pamięci zewnętrznych to jedna z zalet. Drugą niewątpliwie jest to, że w chwili gdy HDD padnie, a my niekoniecznie pamiętamy o robieniu regularnych backup'ów - nic nie tracimy ;)

Pozdrawiam,
JSz